然而,不断的调查之后,一开始的谜团非但没有解开,超级弹丸论破2:再见了绝望学园更多的谜团却一个接一个的涌现出来。从岛上离开的条件是学生们彼此进行自相残杀,然后再强制执行学级裁判,在讨论后找出凶手。在以避暑胜地而负有盛名的贾巴沃克岛上,原本打算享受修学旅行的16名高中生由于校长黑白熊的阴谋而被隔离在这座岛上。