游戏背景设定在第二次末日之战战争,玩家需要指挥帝国的钢铁军团和太空陆战队来对抗Ghazghkull Thraka的兽人军队的入侵。战锤40k:末日之战拥有超过35个任务关卡,超过100种单位类型,每一种都有独特的定位、战锤40k:末日之战属性和特殊能力,总共有20项不同的单位属性。